Veľa účastníkov bolo nadšených takýmto výberom trasy. Pretek bol ale na čas prerušený teroristickými útokmi. Organizátori si priali zabezpečiť bezpečnosť všetkých zúčastnených. Tak sa celá rally presunula vzdušným mostom z Nigérie do Líbye. Z víťazstva pri pyramídach sa tešili tí istí pretekári ako minulý rok. Richard Sainct v kategórii motoriek a Jean-Louis Schlesser v kategórii áut.

• Štart: 6. Január 2000 Dakar (Senegal)
• Cieľ: 23. Január 2000 Cairo (Egypt)
• Deň odpočinku: žiaden
• Dĺžka rally: 7.863 km
• Dĺžka meraných úsekov: 5.012 km
• Prejdené krajiny: Senegal, Mali, Burkina Faso, Nigéria, Líbya, Egypt

Na štarte 365 strojov:

• 200 motoriek
• 135 áut
• 30 nákladiakov

V cieli 225 strojov:

• 107 motoriek
• 95 áut
• 23 nákladiakov

Zaujímavosti:

• Zo západu na východ. Zo Senegalu do Egypta naprieč Afrikou.
• Keďže bola rally pod hrozbou teroristických útokov, rozhodli sa organizátori pre vzdušný most z Nigérie do Líbye. Obrovské lietadlo Antonov 124 prenieslo celú rally (stroje a jazdcov).
• Veľký počet KTM-iek na štarte.
• BMW uchmatlo prvé štyri miesta v kategórii motocyklov.
• 11 štvorkoliek na štarte tohto ročníku rally Dakar.
• Po druhý krát sa cieľ rally nenachádza v Dakare.

Trasa:

• 1. etapa : Dakar – Tambacounda (594 km z toho 284 km meraných)
• 2. etapa : Tambacounda – Kayes (359 km z toho 212 km meraných)
• 3. etapa : Kayes – Bamako (711 km z toho 245 km meraných)
• 4. etapa : Bamako – Bobo Dioulasso (608 km z toho 286 km meraných)
• 5. etapa : Bobo Dioulasso – Ouagadougou (762 km z toho 485 km meraných)
• 6. etapa : Ouagadougou – Niamey ( 733 km z toho 526 km meraných)
• Pretek prerušený na 5dní
• 7. etapa : Sabha – Waw El Kebir (469 km z toho 146 km meraných)
• 8. etapa : Waw El Kebir – Waha (661 km z toho 657 km meraných)
• 9. etapa : Waha – Khofra (647 km z toho 610 km meraných)
• 10. etapa : Khofra – Daklha (852 km z toho 789 km meraných)
• 11. etapa : Daklha – Daklha (606 km z toho 352 km meraných)
• 12. etapa : Daklha – Wadi Rayan (722 km z toho 416 km meraných)
• 13. etapa : Wadi Rayan – Le Caire (139 km z toho 4 km meraných)

Top10

Motorky

1.	SAINCT	BMW	Fra
2.	GALLARDO	BMW	Esp
3.	LEWIS	BMW	Usa
4.	BRUCY	BMW	Fra
5.	MAYER	KTM	All
6.	BERNARD	KTM	Fra
7.	FLICK	KTM	Fra
8.	KNUIMAN	KTM	Hol
9.	PRO VILAR	KTM	Por
10.	YOSHIO	HONDA	Jap

Autá

1.	SCHLESSER/MAGNE	SCH-RENAULT ELF	Fra
2.	PETERHANSEL/COTTRET	MEGA	Fra
3.	FONTENAY/PICARD	MISTUBISHI	Fra
4.	SERVIA/LURQUIN	SCH-RENAULT ELF	Esp
5.	KLEINSCHMIDT/THORNER	MISTUBISHI	All
6.	MASUOKA/SCHULZ	MISTUBISHI	Jap
7.	SABY/TRUELLE	FORD RANGER	Fra
8.	DE LAVERGNE/DUBOIS	NISSAN	Fra
9.	PESCAROLO/GUEHENNEC	NISSAN	Fra
10.	VILA ALTIMIR/TOURINAN	NISSAN	Esp

Nákladiaky

1.	TCHAGUINE/YAKOUBOV/SAVOSTINE	KAMAZ	Rus
2.	LOPRAIS/STACHURA/GILAR	TATRA	Rtc
3.	KABIROV/BELIAEV/GOLOUB	KAMAZ	Rus
4.	DE AZEVEDO/TOMECEK/VODAK	TATRA	Bre
5.	SUGAWARA/SUZUKI/SUGAWARA	HINO	Jap
6.	SKLENOVSKY/KORENY/KALINA	TATRA	Rtc
7.	BAUERLE/SCHURHAGL	MERCEDES	All
8.	BOSONNET/LACOURT/BONNAIRE	MERCEDES	Fra
9.	GIMBRE/MARCHEIX/BUI	MERCEDES	Fra
10.	REIF/DEINHOFER/ROTH	MAN	Aut